VDJ驱动
10X V（D）J数据分析工具
生物导体版本：释放（3.19）
该软件包提供了处理和分析免疫受体储备数据的功能，例如CellRanger V（D）J管道生成的数据。这包括将数据读入R，将其与成对的单细胞数据合并，量化克隆类型丰度，计算多样性度量，以及生成公共图。它实现了用于克隆型分配的E-M算法，以及其他方法，该方法利用不明确的细胞来改进量化。
作者：凯利街[aut，cre]
，Mercedeh Movassagh[作者]，吉尔·伦德尔[aut]，贾里德·布朗[ctb]，黄玲琳[ctb]，叶明志[ctb]
维护人员：凯利街<Street.Kelly at gmail.com>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“VDJdive”）
对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“VDJdive”）
细节
| 生物视图 |
注释,免疫肿瘤学,RNA序列,单个单元格,软件,目标重排序 |
| 版本 |
1.6.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.16（R-4.2）（1.5年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=4.2） |
| 进口 |
生物并行,奶牛场,ggplot2,额外网格,I范围,矩阵、方法、，R彩色啤酒,卢比,S4载体,单细胞实验，统计，总结性实验，实用程序 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/kstreet13/VDJdive |
| 错误报告 |
https://github.com/kstreet13/VDJdive/issues（网址：https://github.com/kstreet13/VDJdive/issues） |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
