UniProt.ws公司

UniProt Web服务的R接口


生物导体版本:释放(3.19)

通用蛋白质资源(UniProt)是蛋白质序列和注释数据的综合资源。此包提供了一组用于检索、处理和重新打包UniProt web服务的函数。该软件包利用了UniProt现代化的RESTAPI,并允许在不同的数据库中映射标识符。

作者:马克·卡尔森[aut],萨巴·奥尔图泰[ctb],马塞尔·拉莫斯[aut,cre]

维护人员:Marcel Ramos<Marcel.Ramos at roswellpark.org>

引文(从R中输入引文(“UniProt.ws”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“UniProt.ws”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“UniProt.ws”)
UniProt.ws:用于从UniProt web服务检索数据的包 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 注释,BioCarta公司,GO(开始),基础设施,KEGG公司,软件
版本 2.44.0
在生物导体中 生物技术2.12(R-3.0)(11.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 生物遗传学、方法、,RSQ网站,实用程序
进口 注释Dbi,生物文件缓存,BiocBaseUtils公司,高温气冷堆,httpcache(http缓存),jsonlite公司,进步,rjsoncons公司
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/Bioconductor/UniProt.ws
错误报告 https://github.com/Bioconductor/UniProt.ws/issues网站
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建议 仿生风格,针织物,rmarkdown公司,RUnit(运行单位)
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导入我 dag徽标,药物靶向相互作用,银杏叶提取物
建议我 自治,切割器,qPLEX分析仪
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 UniProt.ws_2.44.0.tar.gz公司
Windows二进制 UniProt.ws_2.44.0.zip
macOS二进制(x86_64) UniProt.ws_2.44.0.tgz公司
macOS二进制(arm64) UniProt.ws_2.44.0.tgz公司
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/UniProt.ws
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/UniProt.ws
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/UniProt.ws/
包短Url https://bioconductor.org/packages/UniProt.ws/
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