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同步扩展

使用同步对象的工具


生物导体版本:释放(3.19)

基因组序列之间的共享顺序提供了大量信息。R包DECIPHER生成的同步对象提供有关共享顺序的定量信息。SynExtend提供了从Synteny对象中提取信息的工具。

作者:尼古拉斯·库利,艾丹·拉克希曼[aut,ctb]、阿德尔·费尔南多[ctb]、埃里克·赖特[aut]

维护人员:尼古拉斯·库利(Nicholas Cooley)<npc19 at pitt.edu>

引文(从R中输入引文(“SynExtend”))以下为:

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“SyncExtend”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“SynExtend”)
使用SynExtend HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 群集,比较基因组学,数据导入,遗传学,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 生物柴油3.11(R-4.0)(4年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=4.3.0),DECIPHER公司(>= 2.28.0)
进口 方法,生物串,S4载体,I范围、utils、stats、parallel、graphics、grDevices、,RSQ网站,数据库接口
系统要求
统一资源定位地址
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建议 仿生风格,针织者,记录仪,降价,rmarkdown公司
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 同步扩展_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 同步扩展_1.16.0.zip
macOS二进制(x86_64) 同步扩展_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64) 同步扩展_1.16.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SynExtend
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/SynExtend
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SynExtend网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/SynExtend网站/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包 源存档