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子单元格条形码

SubCellBarCode:用于鲁棒映射和可视化整个人类空间蛋白质组的集成工作流


生物导体版本:释放(3.19)

基于质谱的空间蛋白质组学已经实现了蛋白质亚细胞定位的全蛋白质映射(Orre等人,2019,Molecular Cell)。SubCellBarCode R软件包将蛋白质严格分类为相应的亚细胞定位。

作者:塔内·阿斯兰

维护人员:塔内·阿斯兰(Taner Arslan)

引文(从R中输入引文(“SubCellBarCode”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“SubCellBarCode”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“SubCellBarCode”)
SubCellBarCode R降价渐晕 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 分类,质谱学,蛋白质组学,软件
版本 1.20.0
在生物导体中 生物技术3.9(R-3.6)(5年)
许可证 GPL-2型
取决于 R(>=3.6)
进口 Rtsne公司,散点图3d,插入符号,e1071号,ggplot2,额外网格,网络D3,gg排斥,图形,统计,组织健康状况数据库,注释Dbi
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 子单元格条形码_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 子单元格条形码_1.20.0.zip
macOS二进制(x86_64) 子单元格条形码_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64) 子单元格条形码_1.20.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SubCellBarCode
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/SubCellBarCode
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SubCellBarCode网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/SubCellBarCode网站/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包 源存档