备用阵列

R中的高性能稀疏数据表示和操作

生物导体版本：释放（3.19）

SparseArray包提供了类似数组的容器，用于高效地在内存中表示R（数组和矩阵）中的多维稀疏数据。该包定义了SparseArray虚拟类和两个具体的子类：COO_Sparse数组和SVT_SparseArray。每个子类都使用自己的非零多维数据的内部表示：分别是“COO布局”和“SVT布局”。SVT_SparseArray对象尽可能模拟R基中普通矩阵和数组对象的行为。特别是，它们支持R基和CRAN的matrixStats包中定义的大多数“标准矩阵和数组API”。

作者：HervéPagès[aut，cre]、Vince Carey[fnd]、Rafael A.Irizarry[fnd]、Jacques Serizay[ctb]

维护人员：HervéPagès<hpages.on.github at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“SparseArray”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“SparseArray”）

对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“稀疏阵列”）

SparseArray对象	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	数据表示,基础设施,软件
版本	1.4.8
在生物导体中	生物柴油3.17（R-4.3）（1年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.3.0）、方法，矩阵,生物遗传学(>= 0.43.1),矩阵泛型(>= 1.11.1),S4载体,S4阵列(>= 1.4.1)
进口	utils、stats、，矩阵统计,I范围,十六矢量
系统要求
统一资源定位地址	https://bioconductor.org/packages/SparseArray网站
错误报告	https://github.com/Bioconductor/SparseArray/issues网站

建议	延迟阵列,测试,针织物,rmarkdown公司,仿生风格
链接到	S4载体,I范围,十六矢量
增强功能
取决于我	延迟阵列
导入我	雪花石膏基质,海滩上的人,scRNA序列
建议我	矩阵泛型,S4阵列
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	备用阵列_1.4.8.tar.gz
Windows二进制	备用阵列_1.4.8.zip
macOS二进制（x86_64）	备用阵列_1.4.8.tgz
macOS二进制（arm64）	备用阵列_1.4.8.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SparseArray网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/SparseArray
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SparseArray网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/SparseArray网站/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包	源存档