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SC规范

单细胞RNA-seq数据的规范化


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包实现了SCnorm——一种规范化单细胞RNA-seq数据的方法。

作者:朗达·巴赫

维护人员:朗达·巴赫(Rhonda Bacher)<rbacher at uf.edu>

引文(从R中输入引文(“SCnorm”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“SCnorm”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“SCnorm”)
SCnorm渐晕图 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 免疫肿瘤学,规范化,RNA序列,单个单元格,软件
版本 1.26.0
在生物导体中 生物技术3.6(R-3.4)(6.5年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 R(>=3.4.0)
进口 单细胞实验,总结性实验、统计、方法、图形、grDevices、并行、,quantreg公司,集群,力矩,数据表,生物并行,S4载体,ggplot2,对于猫,生物遗传学
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/rhondabacher/SCnorm
错误报告 https://github.com/rhodabacher/SCnorm/issues(网址:https://github.com/rhodabacher/SCnorm/issues)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 SC标准_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 SCnorm_1.26.0.zip标准(仅64位)
macOS二进制(x86_64) SC标准_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) SC标准_1.26.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SCnorm网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/S规范
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SCnorm网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/SCnorm网站/
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