SCBN公司

不同物种RNA-seq数据的统计归一化方法及差异表达分析

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包提供了一种基于尺度的归一化（SCBN）方法来识别不同物种之间差异表达的基因。它考虑了保守同源基因的现有知识和假设检验框架，以检测差异表达的同源基因。Yan Zhou、Jiadi Zhu、Tiejun Tong、Junhui Wang、Bingqing Lin、Jun Zhang（2018年，待出版）在文章“不同物种间RNA-seq数据的统计归一化方法和差异表达分析”中描述了该软件包的方法。

作者：兖州

维护人员：严舟<2160090406，邮箱：email.szu.edu.cn>

引文（从R中输入引文（“SCBN”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）生物管理器：：安装（“SCBN”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“SCBN”）

SCBN教程	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	差异表达式,基因表达式,规范化,软件
版本	1.22.0
在生物导体中	生物技术3.8（R-3.5）（6年）
许可证	GPL-2型
取决于	R（>=3.5.0）
进口	统计数据
系统要求
统一资源定位地址

建议	针织物,rmarkdown公司,仿生风格,生物技术经理
链接到
增强功能
取决于我
导入我	TEKRABber公司
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	SCBN_1.22.0.tar.gz号
Windows二进制	SCBN_1.22.0.zip码
macOS二进制（x86_64）	加拿大国家银行_1.22.0.tgz
macOS二进制（arm64）	SCBN_1.22.0.tgz号
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SCBN
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/SCBN
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SCBN/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/SCBN/
软件包下载报告	下载统计信息