扫描。通用产品代码
单通道阵列归一化（SCAN）和通用压缩码（UPC）
生物导体版本：释放（3.19）
SCAN是一种微阵列标准化方法，用于促进个性化药物工作流。SCAN不是将微阵列样本作为一组进行处理，这可能会引入偏差并带来后勤挑战，而是通过建模并仅使用每个阵列中的数据消除探针和阵列特定的背景噪声，来单独规范每个样本。SCAN可以应用于单通道（例如Affymetrix）或双通道（例如Agilent）微阵列。通用表达码（UPC）方法是SCAN的扩展，用于估计给定基因/转录物在给定样本中是否在背景水平以上处于活动状态。UPC方法可应用于单通道或双通道微阵列以及RNA-Seq读取计数。由于UPC值以相同的比例表示，并且对每个平台具有相同的解释，因此可以用于跨平台数据集成。
作者：斯蒂芬·皮科洛（Stephen R.Piccolo）、安德烈亚·比尔德（Andrea H.Bild）和埃文·约翰逊（W.Evan Johnson）
维护人员：斯蒂芬·皮科洛（Stephen R.Piccolo）
安装
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如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“SCAN.UPC”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
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细节
| 生物视图 |
免疫肿瘤学,微阵列,一个频道,预处理,RNA序列,软件,双通道 |
| 版本 |
2.46.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术2.11（R-2.15）（12年） |
| 许可证 |
麻省理工学院 |
| 取决于 |
R（>=2.14.0），博科生物(>= 2.6.0),寡聚物,生物串,地理查询,阿菲,阿菲奥,foreach公司,特别行政区 |
| 进口 |
实用程序、方法、，MASS（质量）、工具、，I范围 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
http://bioconductor.org http://jlab.bu.edu/software/scan-upc |
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程序包档案
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