Rqc(质量控制)
高通量测序数据的质量控制工具
生物导体版本:释放(3.19)
Rqc是一种优化工具,用于高通量测序数据的质量控制和评估。它对整个文件执行并行处理,并生成包含一组高分辨率图形的报告。
作者:Welliton Souza,Benilton Carvalho<Benilton Carvalho at gmail.com>
维护人员:Welliton Souza<gmail.com上的well309>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“Rqc”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“Rqc”)
细节
生物视图 |
数据导入,质量控制,排序,软件 |
版本 |
1.38.0 |
在生物导体中 |
BioC 3.0(R-3.1)(10年) |
许可证 |
GPL(>=2) |
取决于 |
生物并行,短读,ggplot2 |
进口 |
生物遗传学(>= 0.25.1),生物串,I范围、方法、,S4载体,针织物(>= 1.7),仿生风格,普利尔,降价,网格,重新整形2,卢比(>= 0.11.6),biovizBase公司,闪亮的,Rsamtools软件,基因组比对,基因组文件 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/labbcb/Rqc |
Bug报告 |
https://github.com/labbcb/Rqc/issues网站 |
查看更多
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。