Rqc(质量控制)

高通量测序数据的质量控制工具


生物导体版本:释放(3.19)

Rqc是一种优化工具,用于高通量测序数据的质量控制和评估。它对整个文件执行并行处理,并生成包含一组高分辨率图形的报告。

作者:Welliton Souza,Benilton Carvalho<Benilton Carvalho at gmail.com>

维护人员:Welliton Souza<gmail.com上的well309>

引文(从R中输入引文(“Rqc”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“Rqc”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“Rqc”)
使用Rqc HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 数据导入,质量控制,排序,软件
版本 1.38.0
在生物导体中 BioC 3.0(R-3.1)(10年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 生物并行,短读,ggplot2
进口 生物遗传学(>= 0.25.1),生物串,I范围、方法、,S4载体,针织物(>= 1.7),仿生风格,普利尔,降价,网格,重新整形2,卢比(>= 0.11.6),biovizBase公司,闪亮的,Rsamtools软件,基因组比对,基因组文件
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/labbcb/Rqc
Bug报告 https://github.com/labbcb/Rqc/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 Rqc_1.38.0.tar.gz号
Windows二进制 Rqc_1.38.0.zip码
macOS二进制(x86_64) Rqc_1.38.0.tgz请求
macOS二进制(arm64) Rqc_1.38.0.tgz请求
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rqc
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/Rqc
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/Rqc网址/
包短Url https://bioconductor.org/packages/Rqc/
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