快速响应

一个超快速和全合一Fastq预处理器（质量控制、适配器、低质量和polyX修剪）和UMI序列解析）。

生物导体版本：释放（3.19）

Rfastp是用c++开发的fastp的R包装器。fastp对fastq文件执行质量控制。包括低质量碱基修剪、polyX修剪、适配器自动检测和修剪、成对末端读取合并、UMI序列/id处理。Rfastp可以将多个文件连接到一个文件中（如shell命令cat），并接受多个文件作为输入。

作者：王伟[aut]，吉东洛[ctb]，托马斯·卡罗尔[cre，aut]

维护人员：托马斯·卡罗尔（Thomas Carroll）<tc.infomatics at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“Rfastp”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“Rfastp”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“Rfastp”）

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	快速_ 1.14.0.tar.gz
Windows二进制	Rfastp_1.14.0.zip文件（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	快速_ 1.14.0.tgz
macOS二进制（arm64）	快速_ 1.14.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rfastp
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/Rfastp
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/Rfastp网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/Rfastp/
软件包下载报告	下载统计信息