Phylo配置文件
Phylo配置文件
生物导体版本：释放（3.19）
PhyloProfile是一个用于探索复杂系统发育谱的工具。系统发育剖面，即一组物种上基因的存在/缺失模式，通常用于追踪跨物种和时间的基因功能和进化历史。利用PhyloProfile，我们可以用序列/结构相似性等进一步数据来丰富规则的系统发育谱，使系统发育谱更有意义。除了由R-Shiny提供的交互式可视化功能外，该软件包还提供了一组进一步的分析功能，以获得诸如基因年龄估计或核心基因识别之类的见解。
作者：永创[aut，cre]
、巴斯蒂安·格雷沙克·茨瓦拉斯[aut]、英戈·埃伯斯伯格[aut]:Carla Mölbert[ctb]
维护人员：Vinh Tran<在bio.uni-frankfurt.de的Tran
引文（从R中输入引文（“PhyloProfile”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“PhyloProfile”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“PhyloProfile”）
细节
| 生物视图 |
数据表示,功能预测,多重比较,软件,可视化 |
| 版本 |
1.18.0 |
| 在生物导体中 |
生物C 3.10（R-3.6）（5年） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.3.0） |
| 进口 |
猿,生物分布区,生物风格,生物串,颜色选择器,数据表,DT公司,能量,实验中心,ggplot2,额外网格,pbapply（应用程序）,R彩色啤酒,随机对照URL,闪亮的,闪亮BS,小型装载机,shiny文件,闪耀（shinyjs）,字符串,OmaDB公司,普利尔,xml语言2,动物园,山药 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/BIONF/PhyloProfile网站/ |
| Bug报告 |
https://github.com/BIONF/PhyloProfile/issues网站 |
查看更多
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
