潘维兹
将多麦克风网络数据与总结级GWAS数据集成
生物导体版本:释放(3.19)
该软件包将来自《京都基因和基因组百科全书》(KEGG)的数据与摘要级全基因组关联(GWAS)数据(如GWAS目录或GWAS中央数据库或用户自己的研究或数据集提供的数据)相结合,以生成称为IMON(集成多微网络)的生物网络。IMON可用于分析生化和代谢反应网络背景下的trat-specific多态性数据,为GWAS数据提供更大的生物学解释性。
作者:卢卡·安霍尔特[cre,aut]
维护人员:卢卡·安霍尔特(Luca Anholt)<la1317 at ic.ac.uk>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“PanViz”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
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浏览幻影(“PanViz”)
细节
生物视图 |
基因组广泛协会,图形和网络,KEGG公司,代谢组学,网络,反应途径,SNP公司,软件 |
版本 |
1.6.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.16(R-4.2)(2年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=4.2.0) |
进口 |
第三年,字符串,数字播放器,易怒的,马格里特,无用的日志,实用程序,easycsv公司,伦特斯,记录仪,R彩色啤酒,数据表,色彩空间,gr设备,爱尔兰航空公司,方法 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/LucaAnholt/PanViz |
错误报告 |
https://github.com/LucaAnholt/PanViz/issues网站 |
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程序包档案
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