POWSC公司

单细胞RNA-seq的模拟、功率评估和样本量建议

生物导体版本：释放（3.19）

在高通量实验的设计阶段，确定用于检测统计显著性的足够功率的样本大小是一个关键步骤。尽管有许多方法和工具可用于差异表达（DE）背景下微阵列和RNA-seq的样本量计算，但对单细胞RNA测序领域的这一主题的研究还不够深入。此外，scRNA-seq中存在的独特数据特征，如稀疏性和异质性，增加了挑战。我们建议使用基于模拟的POWSC方法，为单细胞RNA测序DE分析提供功率评估和样本大小建议。POWSC由一个创建真实表达数据的数据模拟器和一个提供功率和样本量关系的综合评估和可视化的功率评估器组成。

作者：苏基农[aut，cre]，吴浩[aut]

维护人员：Kenong Su<Kenong.Su at emory.edu>

引文（从R中输入引文（“POWSC”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“POWSC”）

对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“POWSC”）

POWSC用户指南	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	差异表达式,免疫肿瘤学,单个单元格,软件
版本	1.12.0
在生物导体中	生物化学3.13（R-4.1）（3年）
许可证	GPL-2型
取决于	R（>=4.1），博科生物,单细胞实验,桅杆
进口	情势图,ggplot2,R彩色啤酒，gr设备，总结性实验,利马
系统要求
统一资源定位地址

建议	rmarkdown公司,针织物,测试(>= 3.0.0),仿生风格
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
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生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	POWSC_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	POWSC_1.12.0.zip
macOS二进制（x86_64）	POWSC_1.12.0.tgz公司
macOS二进制（arm64）	POWSC_1.12.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/POWSC
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/POWSC
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/POWSC（网址：https://code.bioconductor.org/browse/POWSC）/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/POWSC/
软件包下载报告	下载统计信息