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皮亚马

基于拓扑数据分析映射器的表型识别


生物导体版本:释放(3.19)

PIUMA软件包提供了一个整洁的拓扑数据分析框架管道,用于识别和表征高维和异构数据中的社区。

作者:马蒂亚·基耶萨[aut,cre],阿里安娜·达利亚蒂[aut],Alessia Gerbasi[aut]、朱塞佩·阿尔比[aut]、劳拉·巴拉里尼[aut'、卢卡·皮亚琴蒂尼[aut]

维护人员:Mattia Chiesa<心脏科医生Mattia.Chiesa

引文(从R中输入引文(“PIUMA”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“PIUMA”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“PIUMA”)
PIUMA包 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 分类,群集,尺寸缩减,图形和网络,网络,软件
版本 1.0.0
在生物导体中 生物C 3.19(R-4.4)(<6个月)
许可证 GPL-3+文件许可证
取决于 R(>=4.3),ggplot2
进口 集群,乌玛,坦桑尼亚先令,内核实验室,素食主义者,聚类算法,记录仪,规模,Hmisc公司,拼凑,gr设备,统计,方法,总结性实验
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/BioinfoMonzino/PIUMA网站
错误报告 https://github.com/BioinfoMonzino/PIUMA/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 PIUMA_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 PIUMA_1.0.0.zip
macOS二进制(x86_64) PIUMA_1.0.0.tgz
macOS二进制(arm64) PIUMA_1.0.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PIUMA网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/PIUMA
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/PIUMA网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/PIUMA网站/
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