OmaDB公司

OMA REST API的R包装器


生物导体版本:释放(3.19)

从OMA数据库下载矫形预测数据的包。

作者:卡拉·卡勒布

维护人员:卡拉·卡莱布<Klara.kaleb18 at ic.ac.uk>,阿德里安·阿尔滕霍夫<Adrian.Altenhoff at inf.ethz.ch>

引文(从R中输入引文(“OmaDB”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“OmaDB”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“OmaDB”)
用OmaDB探索层次直系群 HTML格式 R脚本
使用OmaDB探索分类树 HTML格式 R脚本
OmaDB入门 HTML格式 R脚本
使用OmaDB进行序列映射 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 注释,比较基因组学,功能基因组学,功能预测,GO(开始),遗传学,软件
版本 2.20.0
在生物导体中 生物技术3.7(R-3.5)(6.5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.5),高温气冷堆(>= 1.2.1),普利尔(>= 1.8.4)
进口 实用程序,,生物串,基因组范围,I范围、方法、,topGO(顶GO),jsonlite公司
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/DessimozLab/OmaDB网站
错误报告 https://github.com/DessimozLab/OmaDB/问题
查看更多
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 奥马DB_2.20.0.tar.gz
Windows二进制 OmaDB_2.20.0.zip
macOS二进制(x86_64) 奥马DB_2.20.0.tgz
macOS二进制(arm64) 奥马DB_2.20.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OmaDB
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/OmaDB
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/OmaDB/
包短Url https://bioconductor.org/packages/OmaDB/
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