多RNAflow
用于在多种生物条件下综合分析时间RNA-seq数据的R包
生物导体版本：释放（3.19）
我们的R包MultiRNAflow提供了一个易于使用的统一框架，允许对具有任意数量生物条件和时间点的数据集自动进行无监督和监督（DE）分析。特别是，我们的代码对DE信息进行了深入的下游分析，例如，识别生物条件和每次特定于生物条件的DE基因的时间模式。
作者：鲁道夫·卢巴顿[aut，cre]
，尼古拉斯·香槟[aut，ths]，Laurent Vallat[aut，ths]，皮埃尔·瓦卢伊斯[aut]、Région Grand Est[fnd]、Cancéropóle Est[fnd]
维护人员：鲁道夫·卢巴顿（Rodolphe Loubaton）
引文（从R中输入引文（“MultiRNAflow”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）生物管理器：：安装（“MultiRNAflow”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“MultiRNAflow”）
细节
| 生物视图 |
群集,差异表达式,基因表达式,GeneSet扩展,规范化,路径,预处理,主要组件,RNA序列,排序,软件,时间课程,转录,可视化 |
| 版本 |
1.2.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.18（R-4.3）（0.5年） |
| 许可证 |
GPL-3|文件许可证 |
| 取决于 |
M模糊（>=2.58.0），R（>=4.3） |
| 进口 |
博科生物(>= 2.54.0),复杂热图(>= 2.14.0),DESeq2公司(>= 1.38.1),事实附加(>= 1.0.7),事实矿工(>= 2.6),gg冲积层(>= 0.12.3),ggplot2(>= 3.4.0),ggplotify（图形化）(>= 0.1.2),gg排斥(>= 0.9.2),g配置文件2（>=0.2.1）、图形（>=4.2.2）、grDevices（>=42.2）、网格（>=4.2.2），打印3D(>= 1.4),绘图3Drgl(>= 1.0.3),重塑2(>= 1.4.4),S4载体（>=0.36.2），统计（>=4.2.2），总结性实验(>= 1.28.0),UpSetR（升级程序）（>=1.4.0），utils（>=4.2.2） |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/loubator/MultiRNAflow网站 |
| 错误报告 |
https://github.com/loubator/MultiRNAflow/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
