MsBackendMassbank

MassBank记录文件的质谱数据后端


生物导体版本:释放(3.19)

质谱(MS)数据后端支持从MassBank记录文件导入和导出MS/MS库光谱。提供了不同的后端,允许以纯MassBank文本文件格式处理数据,也允许直接与MassBankSQL数据库交互。此包中的物体应与Spectra Bioconductor包一起使用。因此,该软件包为Spectra软件包添加了MassBank支持。

作者:RforMasssometry软件包维护人员[cre],Michael Witting[aut],约翰·雷纳[aut],迈克尔·斯特拉夫斯

维护人员:RforMassSpectrometry软件包维护者<RforMassSpectrometry.org上的维护者>

引文(从R中输入引文(“MsBackendMassbank”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“MsBackendMassbank”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“MsBackendMassbank”)
MsBackendMassbank的说明和用法 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 数据导入,基础设施,质谱学,代谢组学,软件
版本 1.12.0
在生物导体中 生物C 3.13(R-4.1)(3.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.0),光谱(>= 1.9.12)
进口 生物并行,S4载体,I范围、方法、,ProtGenerics公司(>= 1.35.3),MsCoreUtils(MsCore实用程序),数据库接口,实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMassbank
错误报告 https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMassbank/issues
查看更多
建议 测试那个,针织物(>= 1.1.0),氧气2,仿生风格(>= 2.5.19),RSQ网站,rmarkdown公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 MsBackendMassbank_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 MsBackendMassbank_1.12.0.zip
macOS二进制(x86_64) MsBackendMassbank_1.12.0.tgz消息
macOS二进制(arm64) MsBackendMassbank_1.12.0.tgz消息
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendMassbank
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MsBackendMassbank
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MsBackendMassbank/
包短Url https://bioductor.org/packages/MsBackendMassbank/
软件包下载报告 下载统计信息