MetNet公司
从非目标高分辨率质谱数据推断代谢网络
生物导体版本：释放（3.19）
MetNet包含从定量数据和高分辨率质量/电荷信息推断代谢网络拓扑的功能。使用统计模型（包括相关性、互信息、回归和贝叶斯统计）和定量数据（特征强度值），推断出可以组合成一致矩阵的邻接矩阵。计算出的特征质量/电荷值之间的质量差异将与提供的质量/电荷差异的数据框架进行匹配，该差异涉及酶活性的转换。在第三步中，将这两个层次的信息组合起来，形成从定量信息和结构信息推断出的邻接矩阵。
作者：托马斯·纳克[aut，cre]，利萨·萨尔泽[ctb]
维护人员：托马斯·纳克（Thomas Naake）<googlemail.com>
安装
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如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MetNet”）
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文档
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细节
| 生物视图 |
免疫肿瘤学,质谱学,代谢组学,网络,回归,软件 |
| 版本 |
1.22.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.8（R-3.5）（6年） |
| 许可证 |
GPL（>=3） |
| 取决于 |
R（>=4.0），S4载体(>= 0.28.1),总结性实验(>= 1.20.0) |
| 进口 |
bn学习(>= 4.3),生物并行(>= 1.12.0),公司(>= 1.6.10),数字播放器(>= 1.0.3),ggplot2(>= 3.3.3),通用网络(>= 1.2.15),第3代（>=1.7.0），方法（>=3.5），帕尔米根(>= 1.0.2),心理(>= 2.1.6),爱尔兰航空公司(>= 0.4.10),刺伤（>=0.6），统计（>=3.6），易怒的(>= 3.0.5),第三年(>= 1.1.2) |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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程序包档案
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