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梅丽莎

单细胞甲基体的贝叶斯聚类和插补


生物导体版本:释放(3.19)

Melissa是一个Baysian概率模型,用于联合聚类和输入单细胞甲基体。这是通过使用广义线性模型方法考虑局部相关性和使用混合建模方法考虑全局相似性来实现的。

作者:C.A.Kapourani【aut,cre】

维护人员:C.A.Kapourani<kapouranis.andreas at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“梅丽莎”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“梅丽莎”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“梅丽莎”)
1:处理和过滤scBS-seq数据 HTML格式 R脚本
2:使用Melissa对scBS-seq数据进行聚类和估算 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 贝叶斯主义者,群集,新闻报道,DNA甲基化,表观遗传学,特征提取,基因表达式,基因调控,遗传学,免疫肿瘤学,KEGG公司,RNA序列,回归,排序,单个单元格,软件
版本 1.20.0
在生物导体中 生物技术3.9(R-3.6)(5年)
许可证 GPL-3|文件许可证
取决于 R(>=3.5.0),BPRMeth公司,基因组范围
进口 数据表,平行,收益率,矩阵(matrixcalc),麦克卢斯特,ggplot2,do并行,foreach公司,MCMC组件,奶牛场,马格里特,mvtnorm公司,树干规范,断言,生物风格,统计,实用程序
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 梅丽莎_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 梅丽莎_1.20.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 梅丽莎_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64) 梅丽莎_1.20.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Melissa网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/梅丽莎
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/Melissa网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/Melissa网站/
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