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MatrixRider公司

获取给定序列上结合位点矩阵的总亲和力和占用率


生物导体版本：释放（3.19）

计算反映DNA结合蛋白与之相互作用倾向的整个序列的单个数字。DNA结合蛋白必须用PFM矩阵描述，例如从Jaspar获得。

作者：埃琳娜·格拉西

维护人员：Elena Grassi<Grassi.e at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“MatrixRider”）)以下为：

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MatrixRider”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

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总亲和力和占用率 PDF格式 R脚本
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细节

生物视图 基因调控,遗传学,Motif注释,软件
版本 1.36.0
在生物导体中 生物技术3.1（R-3.2）（9年）
许可证 GPL-3公司
取决于 R（>=3.1.2）
进口 方法，TFBS工具,I范围,十六矢量,生物串
系统要求
统一资源定位地址
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建议 RUnit（运行单位）,生物遗传学,仿生风格,JASPAR2014年
链接到 I范围,十六矢量,生物串,S4载体
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 矩阵附件_1.36.0.tar.gz
Windows二进制 MatrixRider_1.36.0.zip手机
macOS二进制（x86_64） 矩阵附件_1.36.0.tgz
macOS二进制（arm64）
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MatrixRider网站
源存储库（开发人员访问） git克隆git@git.bioconductor.org：包装/MatrixRider
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MatrixRider网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/MatrixRider网站/
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