马卡隆
流行病学和环境代谢组学数据集中潜在生物活性代谢特征的优先级
生物导体版本：释放（3.19）
Macarron是代谢组学实验中潜在生物活性代谢物优先排序的工作流。优先级综合了生物活性证据的优势，例如与已知代谢物的共变、相对于已知代谢体的丰度以及与生物活性的环境或表型指标的关联。大体上，该工作流程包括代谢谱特征的分层聚类，这些特征在某种条件下的丰度存在差异，功能注释的转移，相对丰度的估计和差异丰度分析，以确定特征和表型/条件之间的关联。
作者：Amrisha Bhosle[aut]，Ludwig Geistlinger[aut]Sagun Maharjan[aut，cre]
维护人员：萨根·马哈詹（Sagun Maharjan）
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“Macarron”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“Macarron”）
细节
| 生物视图 |
群集,新闻报道,功能预测,代谢组学,排序,软件 |
| 版本 |
1.8.1 |
| 在生物导体中 |
生物C 3.15（R-4.2）（2.5年） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.2.0），总结性实验 |
| 进口 |
生物并行,DelayedArray（延迟阵列）,WGCNA公司,ff（关闭）,数据表,动态树剪切,马斯林2,普利尔，统计，心理,xml语言2,高温气冷堆,RJSONIO公司,登录中、方法、实用程序 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
http://huttenhower.sph.harvard.edu/macarron |
| 错误报告 |
https://forum.biobakery.org/c/microbial-community-profiling/macarron网站 |
查看更多
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
