MSstatsLOBD公司

分析表征：白细胞限度（LoB）和检测限度（LOD）的估计

生物导体版本：释放（3.19）

MSstatsLOBD包允许计算和可视化blac极限（LOB）和检测极限（LOD）。我们将LOB定义为在重复测量不含肽的空白样品时预期的肽的最高表观浓度。LOD定义为测量的浓度值，其中错误声称样品中没有肽的概率为0.05，假设错误声称其存在的概率为0.05。这些功能以前是MSstats包的一部分。该方法见Galitzine（2018）.

作者：德文·科勒[aut，cre]，马特乌斯·斯坦尼亚克[aut]，西里尔·加利钦[aut'，米娜·崔[aut]，奥尔加·维泰克[aut]

维护人员：德文·科勒（Devon Kohler）<Kohler.d at东北部.edu>

引文（从R中输入引文（“MSstatsLOBD”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“MSstatsLOBD”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“MSstatsLOBD”）

LOB/LOD估算工作流	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式

需要帮助吗？请访问生物导体支持网站！

细节

生物视图	差异表达式,免疫肿瘤学,质谱学,规范化,一个频道,蛋白质组学,质量控制,软件,双通道
版本	1.12.0
在生物导体中	生物C 3.13（R-4.1）（3.5年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.0）
进口	最小包装.lm,ggplot2、utils、stats、grDevices
系统要求
统一资源定位地址
错误报告	https://github.com/Vitek-Lab/MSstatsLODQ/问题

建议	仿生风格,针织物,rmarkdown公司,覆盖（covr）,小测试,数字播放器
链接到	卢比
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	MS统计LOBD_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	MSstatsLOBD_1.12.0.zip
macOS二进制（x86_64）	MS统计LOBD_1.12.0.tgz
macOS二进制（arm64）	MS统计LOBD_1.12.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstatsLOBD
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/MSstatsLOBD
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MSstatsLOBD/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/MSstatsLOBD/
软件包下载报告	下载统计信息