MQ度量
蛋白质组学数据的质量控制
生物导体版本:释放(3.19)
MQmetrics(MaxQuant metrics)包提供了一个工作流,用于分析MaxQuant蛋白质组学质谱分析的质量和再现性。从几个MaxQuant输出表中提取输入数据并生成pdf报告。它包括多个可视化工具,用于检查有关管路质量的许多参数。它还包括两个功能,以可视化Biognosys的iRT肽,以防其在样本中被添加。
作者:阿尔瓦罗·桑切斯·维拉尔巴[aut,cre],托马斯·斯特勒[aut],马雷克·弗巴基[aut]
维护人员:阿尔瓦罗·桑切斯·维拉尔巴(Alvaro Sanchez-Villalba)
引文(从R中输入引文(“MQmetrics”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“MQmetrics”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
细节
生物视图 |
数据导入,基础设施,质谱学,蛋白质组学,质量控制,软件 |
版本 |
1.12.0 |
在生物导体中 |
生物化学3.13(R-4.1)(3年) |
许可证 |
GPL-3型 |
取决于 |
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进口 |
ggplot2,阅读器,马格里特,数字播放器,呜呜声,重塑2,额外网格,实用程序,字符串,ggpubr公司,统计,奶牛场,R彩色啤酒,第三年,规模,网格,爱尔兰航空公司,gg力,gr设备,gtable表,普利尔,针织物,rmarkdown公司,gg排斥,gghalfs(gghalf),工具 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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查看更多
建议 |
测试那个(>= 3.0.0),生物风格 |
链接到 |
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增强功能 |
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取决于我 |
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导入我 |
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建议我 |
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指向我的链接 |
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生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。