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MQ度量

蛋白质组学数据的质量控制


生物导体版本:释放(3.19)

MQmetrics(MaxQuant metrics)包提供了一个工作流,用于分析MaxQuant蛋白质组学质谱分析的质量和再现性。从几个MaxQuant输出表中提取输入数据并生成pdf报告。它包括多个可视化工具,用于检查有关管路质量的许多参数。它还包括两个功能,以可视化Biognosys的iRT肽,以防其在样本中被添加。

作者:阿尔瓦罗·桑切斯·维拉尔巴[aut,cre],托马斯·斯特勒[aut],马雷克·弗巴基[aut]

维护人员:阿尔瓦罗·桑切斯·维拉尔巴(Alvaro Sanchez-Villalba)

引文(从R中输入引文(“MQmetrics”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“MQmetrics”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

参考手册 PDF格式

细节

生物视图 数据导入,基础设施,质谱学,蛋白质组学,质量控制,软件
版本 1.12.0
在生物导体中 生物化学3.13(R-4.1)(3年)
许可证 GPL-3型
取决于
进口 ggplot2,阅读器,马格里特,数字播放器,呜呜声,重塑2,额外网格,实用程序,字符串,ggpubr公司,统计,奶牛场,R彩色啤酒,第三年,规模,网格,爱尔兰航空公司,gg力,gr设备,gtable表,普利尔,针织物,rmarkdown公司,gg排斥,gghalfs(gghalf),工具
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MQmetrics网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/MQmetrics
包短Url https://bioductor.org/packages/MQmetrics(https://bioductor.org/packages/MQmetrics)/
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