MIRA公司

基于甲基化的调节活性推断

生物导体版本：释放（3.19）

DNA甲基化包含有关细胞调节状态的信息。MIRA将基因组水平的DNA甲基化数据聚集到具有共享生物注释的给定区域集的DNA甲基化谱中。MIRA使用此配置文件推断并评分区域集的集体监管活动。MIRA有助于在经典监管分析困难的情况下进行监管分析，并允许利用区域集的公共来源对DNA甲基化数据集的监管状态进行新的了解。

作者：内森·谢菲尔德<http://www.databio.org>[aut]，Christoph Bock[ctb]，John Lawson[aut，cre]

维护人员：约翰·劳森（John Lawson）<jtl2hk at virginia.edu>

引文（从R中输入引文（“MIRA”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MIRA”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

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浏览幻影（“MIRA”）

将MIRA应用于生物学问题	HTML格式	R脚本
基于甲基化的调控活动推断入门	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	ChIPSeq公司,新闻报道,脱氧核糖核酸甲基化,表观遗传学,功能基因组学,基因调控,基因组注释,免疫肿瘤学,甲基Seq,排序,软件,系统生物学
版本	1.26.0
在生物导体中	生物技术3.6（R-3.4）（6.5年）
许可证	GPL-3型
取决于	R（>=3.5）
进口	生物遗传学,S4载体,I范围,基因组范围,数据表,ggplot2,博科生物，统计，bsseq公司，方法
系统要求
统一资源定位地址	http://databio.org/mira
错误报告	https://github.com/databio/MIRA

建议	针织物，平行，测试那个,仿生风格,rmarkdown公司,批注中心,洛拉
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导入我	可可
建议我
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生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	MIRA_1.26.0.tar.gz公司
Windows二进制	MIRA_1.26.0.zip码
macOS二进制（x86_64）	MIRA_1.26.0.tgz
macOS二进制（arm64）	MIRA_1.26.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MIRA
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/MIRA
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MIRA网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/MIRA/
软件包下载报告	下载统计信息