MGnifyR公司

EBI MGnify宏基因组学资源的R接口

生物导体版本：释放（3.19）

促进R中EBI MGnify数据集成和分析的实用程序包。该程序包可用于将微生物数据导入TreeSummarizedExperiment（TreeSE）。在TreeSE格式中，数据与miaverse框架直接兼容。

作者：托马斯·博尔曼[aut，cre]、本·艾伦[aut]、利奥·拉赫蒂[aut'

维护人员：Tuomas Borman<Tuomas.v.Borman at utu.fi>

引文（从R中输入引文（“MGnifyR”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MGnifyR”）

对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“MGnifyR”）

生物视图	数据导入,基础设施,基因组,软件
版本	1.0.0
在生物导体中	生物活性碳3.19（R-4.4）（<6个月）
许可证	Artistic-2.0 \|文件许可证
取决于	R（>=4.4.0），多重分析实验,树总结实验,总结性实验,生物遗传学
进口	米娅,猿,数字播放器,httr公司、方法、，普利尔,重塑2,S4载体,URL工具，实用程序，蒂迪杰森
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/EBI-Metagenomics/MGnifyR
错误报告	https://github.com/EBI-Metagenomics/MGnifyR/问题

建议	生物格式,扫帚,ggplot2,针织物,rmarkdown公司,测试,xml语言2,仿生风格,迈阿维兹,素食主义者,拾荒者,类毒素,魔法
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	MGnifyR_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	MGnifyR_1.0.0.zip文件
macOS二进制（x86_64）	MGnifyR_1.0.0.tgz
macOS二进制（arm64）	MGnifyR_1.0.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MGnifyR
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/MGnifyR
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MGnifyR网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/MGnifyR/
软件包下载报告	下载统计信息