MBASED标准

使用基于Meta分析的等位基因特异性表达检测进行ASE分析的包含函数的软件包

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包实现了MBASED算法，用于从RNA计数数据中检测等位基因特异性基因表达，其中单个位点的等位基因计数（SNV）被整合到ASE的基因特异性测量中，并利用模拟来适当评估观察到的ASE的统计显著性。

作者：Oleg Mayba，休斯顿吉尔伯特

维护人员：奥列格·梅巴（Oleg Mayba）<Mayba.Oleg at gene.com>

引文（从R中输入引文（“MBASED”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MBASED”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“MBASED”）

生物视图	基因表达式,排序,软件,转录
版本	1.38.0
在生物导体中	生物技术3.0（R-3.1）（9.5年）
许可证	艺术-2.0
取决于	RUnit（运行单位）,生物遗传学,生物并行,基因组范围,总结性实验
进口
系统要求
统一资源定位地址

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	MBASED_1.38.0.tar.gz标准
Windows二进制	MBASED_1.38.0.zip标准（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	MBASED_1.38.0.tgz标准
macOS二进制（arm64）	MBASED_1.38.0.tgz标准
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBASED网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/MBASED
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MBASED网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/MBASED网站/
软件包下载报告	下载统计信息