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基于MBASED的

使用基于Meta分析的等位基因特异性表达检测进行ASE分析的包含函数的软件包


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包实现了MBASED算法,用于从RNA计数数据中检测等位基因特异性基因表达,其中单个位点的等位基因计数(SNV)被整合到ASE的基因特异性测量中,并利用模拟来适当评估观察到的ASE的统计显著性。

作者:Oleg Mayba,休斯顿吉尔伯特

维护人员:奥列格·梅巴(Oleg Mayba)<Mayba.Oleg at gene.com>

引文(从R中输入引文(“MBASED”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MBASED”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“MBASED”)
基于MBASED的 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基因表达式,排序,软件,转录
版本 1.38.0
在生物导体中 生物技术3.0(R-3.1)(9.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 RUnit(运行单位),生物遗传学,生物并行,基因组范围,总结性实验
进口
系统要求
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 MBASED基础_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 MBASED_1.38.0.zip标准(仅64位)
macOS二进制(x86_64) MBASED_1.38.0.tgz标准
macOS二进制(arm64) MBASED_1.38.0.tgz标准
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBASED网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/MBASED
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MBASED网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/MBASED网站/
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