IsoCorrectorR(等参比修正值)

稳定同位素标记实验MS和MS/MS数据中天然同位素丰度和示踪剂纯度的校正


生物导体版本:释放(3.19)

IsoCorrectoR对稳定同位素标记/跟踪代谢组学实验中有关天然同位素丰度和示踪杂质的质谱数据进行校正。可以校正来自MS和MS/MS测量的数据(使用任何示踪同位素:13C、15N、18O…),以及来自多个示踪实验的超高分辨率MS数据(例如,同时使用13C和15N)。有关IsoCorrectoR的图形用户界面,请参阅Bioconductor软件包IsoCorcortoRGUI。注意:对于R版本4.0.0,将更正结果写入Excel文件目前在Windows上可能不起作用。然而,将结果写入csv与以前一样有效。

作者:克里斯蒂安·科勒[cre,aut],保罗·海因里希[aut]

维护人员:克里斯蒂安·科勒(Christian Kohler)

引文(从R中输入引文(“IsoCorrectoR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“IsoCorrectoR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“IsoCorrectoR”)
IsoCorrectorR(等参比修正值) HTML格式 R脚本
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新闻 文本

细节

生物视图 免疫肿瘤学,质谱学,代谢组学,预处理,软件
版本 1.22.0
在生物导体中 生物技术3.8(R-3.5)(6年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.5)
进口 数字播放器,马格里特、方法、,二次规划优化函数,阅读器,读xl,字符串,易怒的、工具、实用程序,普拉克马,WriteXLS(写入XLS)
系统要求
统一资源定位地址 https://genomics.ur.de/files/IsoCorrectoR/
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 IsoCorrectoroR_1.22.0.tar.gz等距修正
Windows二进制 IsoCorrectoR_1.22.0.zip格式
macOS二进制(x86_64) 等校正R_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64) IsoCorrectoR_1.22.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IsoCorrectoR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/IsoCorrectoR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/IsoCorrectoR/
包短Url https://bioconductor.org/packages/IsoCorrectoR/
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