ISLET公司

个别特定ceL典型参考工具

生物导体版本：释放（3.19）

ISLET是一种对一般经济学数据进行信号反褶积的方法。当从每个受试者身上观察到多个样本时，它可以估计个体特定和细胞类型特定的参考面板。它输入观察到的混合物数据（逐样本特征矩阵）、细胞类型混合物比例（逐细胞类型矩阵）和样本到受试者的信息。它可以在个体基础上解决参考群体的问题，并进行检测以识别细胞型特异性差异表达（csDE）基因。它还通过集成个性化参考面板改进了估计的细胞类型混合比例。

作者：郝峰[aut，cre]，钱丽[aut]，关群梦[aut]

维护人员：郝峰<hxf155 at case.edu>

引文（从R中输入引文（“ISLET”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“ISLET”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“ISLET”）

使用ISLET进行个体特异性和细胞类型特异性反褶积	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	差异表达式,差异甲基化,基因表达式,RNA序列,排序,软件,转录,转录组学
版本	1.6.0
在生物导体中	生物柴油3.16（R-4.2）（2年）
许可证	GPL-2型
取决于	R（>=4.2.0），矩阵，平行，生物并行,总结性实验,生物遗传学,lme4公司,nnls公司
进口	统计、方法、，呜呜声,阿宾德
系统要求
统一资源定位地址

建议	仿生风格,针织物,rmarkdown公司,html工具,RUnit（运行单位）,数字播放器
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	ISLET_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	ISLET_1.6.0.zip码
macOS二进制（x86_64）	ISLET_1.6.0.tgz标准
macOS二进制（arm64）	ISLET_1.6.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ISLET
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/ISLET
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ISLET网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/ISLET/
软件包下载报告	下载统计信息