I分析
分析从基因组学下一代测序读取中确定的基因治疗载体插入位点数据，用于克隆追踪研究
生物导体版本：释放（3.19）
在基因治疗中，干细胞使用病毒载体进行修饰，以传递治疗性转基因并替换功能特性，因为基因修饰在所有细胞后代中都是稳定的和遗传的。检索和绘制病毒宿主DNA连接两侧的序列可以识别插入位点（IS），这对于监测体内转基因细胞的进化至关重要。需要一个用于IS分析的综合工具包来促进克隆追踪研究，并支持体内安全性和长期疗效评估。该软件包旨在（1）支持is工作流的自动化，（2）执行is跟踪的基础和高级分析（克隆丰度、克隆扩增和插入突变统计等），（3）提供体内转导干细胞的基本生物学见解。
作者：朱利娅·佩斯[aut，cre]
，安德烈亚·卡拉布里亚[aut]，朱利奥·斯宾诺齐[aut]
维护人员：朱利娅·佩斯（Giulia Pais）<giuliapais1 at gmail.com>
引文（从R中输入引文（“ISAnalytics”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“ISAnalytics”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“ISAnalytics”）
细节
| 生物视图 |
生物医学信息学,排序,单个单元格,软件 |
| 版本 |
1.14.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.12（R-4.0）（3.5年） |
| 许可证 |
抄送4.0 |
| 取决于 |
R（>=4.3） |
| 进口 |
实用程序，数字播放器,阅读器,第三年,呜呜声,爱尔兰航空公司,易怒的,字符串,英尺,杂交的,生命周期,ggplot2,gg排斥，统计，读xl、工具、gr设备、，对于猫,胶,闪亮的,闪亮小工具,数据模型,bslib数据库,DT公司 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://calabrialab.github.io/I分析 https://github.com//calabrialab/isanalytics网站 https://calabrialab.github.io/ISA分析/ |
| 错误报告 |
https://github.com/calabrialab/I分析/问题 |
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程序包档案
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