HybridExpress混合动力
杂种及其祖细胞RNA-seq数据的比较分析
生物导体版本:释放(3.19)
HybridExpress可用于对杂种(或异源多倍体)与其祖先物种进行比较转录组学分析。该软件包具有以下功能:对样本分组进行探索性分析,识别杂种相对于其祖先的差异表达基因,将基因分为表达类别(N=12)和类别(N=5),并进行功能分析。我们还为用户提供图形功能,以便无缝创建文献中常用的公开现成图形。
作者:法布里西奥·阿尔梅达·席尔瓦[aut,cre],卢卡斯·普罗斯特·博科恩,伊夫·范·德·佩尔[aut]
维护人员:Fabricio Almeida-Silva<Fabricio_almeidasilva at hotmail.com>
引文(从R中输入引文(“HybridExpress”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“HybridExpress”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“HybridExpress”)
细节
生物视图 |
分类,差异表达式,功能基因组学,基因表达式,RNA序列,软件,转录组学 |
版本 |
1.0.0 |
在生物导体中 |
生物C 3.19(R-4.4)(<6个月) |
许可证 |
GPL-3型 |
取决于 |
R(>=4.3.0) |
进口 |
ggplot2,拼凑的,爱尔兰航空公司,DESeq2公司,总结性实验,统计数据,方法,R彩色啤酒,复杂热图,gr设备,生物并行 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/almeidasilvaf/HybridExpress网站 |
错误报告 |
https://support.bioconductor.org/tag/HybridExpress网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。