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格拉迪亚托克斯

处理高内容筛选数据的R包


生物导体版本:释放(3.19)

GladiaTOX R包是一个开源、灵活的解决方案,用于生物医学研究中的高内容筛选数据处理和报告。GladiaTOX利用了tcpl的核心功能并提供了一些扩展:它提供了一个web服务解决方案来获取原始数据;它计算严重性得分并导出ToxPi格式的文件;此外,它还包含一套生成pdf报告的功能,用于质量控制和数据处理。

作者:Vincenzo Belcastro[aut,cre],Dayne L Filer[aut],Stephane Cano[aut'

维护人员:PMP S.A.R支持<DL。R pmi.com上的支持>

引文(从R中输入引文(“GladiaTOX”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“GladiaTOX”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“GladiaTOX”)
格拉迪亚托克斯 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 规范化,预处理,质量控制,软件,工作流步骤
版本 1.20.0
在生物导体中 生物技术3.9(R-3.6)(5年)
许可证 GPL-2型
取决于 R(>=3.6.0),数据表(>= 1.9.4)
进口 数据库接口,RMariaDB数据库,RSQ网站,数字派生,R彩色啤酒、并行、统计、方法、图形、grDevices、,xtable的、工具、,酿造,字符串,RJSONIO公司,ggplot2,gg排斥,第三年,实用程序,RCurl(RCurl),XML格式
系统要求
统一资源定位地址
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 角斗士TOX_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 GladiaTOX_1.20.0.zip公司
macOS二进制(x86_64) 格拉迪亚托克斯_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64) 格拉迪亚托克斯_1.20.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GladiaTOX网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/GladiaTOX
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/GladiaTOX网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/GladiaTOX网站/
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