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GNOSIS公司

在R中使用统计和生存分析的基因组探险家


生物导体版本:释放(3.19)

GNOSIS集成了一系列R包,使用户能够有效地探索和可视化从cBioPortal获得的临床和基因组数据。GNOSIS使用直观的GUI和支持一系列功能的多个选项卡面板。这些包括数据上传和初步探索、数据记录和细分、多重可视化、生存分析、统计分析和突变分析,以及促进可重复性研究。

作者:莉迪亚·金马塞尔·拉莫斯

维护人员:利迪亚·金(Lydia King)在哈佛大学

引文(从R中输入引文(“GNOSIS”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“GNOSIS”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“GNOSIS”)
GNOSIS概述 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本
GNOSIS:一款R Shiny应用程序,支持使用cBioPortal进行癌症基因组存活分析 视频

细节

生物视图 图形用户界面,ShinyApps公司,软件,生存
版本 1.2.0
在生物导体中 生物柴油3.18(R-4.3)(0.5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.3.0),闪亮的,闪亮的仪表板,闪亮仪表板Plus,仪表板元素,闪亮小工具,日照强度,潮汐,操作员工具,黑手党
进口 DT公司,方太棒了,小贩,cBioPortalData公司,闪耀(shinyjs),重塑2,R彩色啤酒,生存,监督员,统计,比较组,rpart公司,聚会,描述工具,汽车,rstatix公司,制造商,石柱,马格里特
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/Lydia-King/GNOSIS网站/
错误报告 https://github.com/Lydia-King/GNOSIS/问题
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 GNOSIS_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 GNOSIS_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64) GNOSIS_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64) GNOSIS_1.2.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GNOSIS
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/GNOSIS
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/GNOSIS网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/GNOSIS/
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