注册打开对于生物20247月24-26日

保险丝SOM

基于相关性的IMC数据集多视图自组织映射聚类


生物导体版本:释放(3.19)

高度复用原位成像细胞术分析中细胞类型特征的基于相关性的多视图自组织图(`FuseSOM`)是一种用于无监督聚类的工具。“FuseSOM”通过将“自组织映射”体系结构和基于相关性的度量的“多视图”集成相结合,具有强大的功能并实现了高精度。这使得FuseSOM能够对高度复用的原位成像细胞分析进行聚类。

作者:以利亚·威利

维护人员:伊利亚·威利(Elijah Willie)在悉尼大学(uni.sydney.edu.au)<ewil3501

引文(从R中输入引文(“FuseSOM”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“FuseSOM”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“FuseSOM”)
FuseSOM包手册 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基于细胞的分析,群集,单个单元格,软件,空间
版本 1.6.0
在生物导体中 生物柴油3.16(R-4.2)(1.5年)
许可证 GPL-2型
取决于 R(>=4.2.0)
进口 心理,功能控制点,模拟,笼子,情势图,ggplotify(图形化),快速群集,消防车,ggplot2,字符串,ggpubr公司,代理,集群,浸入试验、方法、,总结性实验,统计,S4载体
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/ecool50/FuseSOM/issues网站
查看更多
建议 针织物,仿生风格,rmarkdown公司,单细胞实验
链接到 卢比
增强功能
取决于我
导入我
建议我 spicyWorkflow(spicy工作流)
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 保险丝SOM_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 保险丝SOM_1.6.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 保险丝SOM_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64) 保险丝SOM_1.6.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FuseSOM网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/FuseSOM
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/FuseSOM网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/FuseSOM网站/
软件包下载报告 下载统计信息