快速清洁剂

FASTQ文件质量控制、过滤和修剪的一个新应用

生物导体版本：释放（3.19）

一个交互式web应用程序，用于FASTQ文件的质量控制、过滤和修剪。这个用户友好的工具将基于Biostring和ShortRead基础设施的数据处理管道与尖端的视觉环境相结合。可以在本地处理单读和配对文件。为输入和输出文件提供诊断交互式绘图（CG内容、每个基本序列的质量等）。

作者：Leandro Roser[aut，cre]，Fernán Agüero[aut]，Daniel Sánchez[aut'

维护人员：莱安德罗·罗斯（Leandro Roser）<learoser at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“FastqCleaner”）)以下为：

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“FastqCleaner”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“FastqCleaner”）

生物视图	质量控制,SangerSeq公司,序列匹配,排序,软件
版本	1.22.0
在生物导体中	生物技术3.8（R-3.5）（5.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于
进口	方法，闪亮的，统计，I范围,生物串,ShortRead（短阅读）,DT公司,S4载体、图形、，html工具,闪亮BS,卢比(>= 0.12.12)
系统要求
统一资源定位地址

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	快速清洁剂_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	FastqCleaner_1.22.0.zip快速清洁剂
macOS二进制（x86_64）	快速清洁剂_1.22.0.tgz
macOS二进制（arm64）	快速清洁剂_1.22.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FastqCleaner网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/FastqCleaner
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/FastqCleaner网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/FastqCleaner网站/
软件包下载报告	下载统计信息