ENmix公司
Illumina DNA甲基化珠芯片的质量控制和分析工具
生物导体版本:释放(3.19)
用于定量控制、分析和可视化Illumina DNA甲基化阵列数据的工具。
作者:徐宗丽[cre,aut],牛良玉[aut]和杰克·泰勒[ctb]
维护人员:徐宗立<xuz at niehs.nih.gov>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“ENmix”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“ENmix”)
细节
生物视图 |
BatchEffect(批次效果),脱氧核糖核酸甲基化,数据导入,差异甲基化,表观遗传学,免疫肿瘤学,甲基化阵列,微阵列,多通道,规范化,一个频道,预处理,主要组件,质量控制,回归,软件,双通道 |
版本 |
1.40.2 |
在生物导体中 |
生物C 3.1(R-3.2)(9.5年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
平行,do并行,foreach公司,总结性实验,统计,R(>=3.5.0) |
进口 |
gr设备、图形、,矩阵统计、方法、实用程序,厄尔巴,基因绘图仪,插补,米菲,RPMM公司,照明,动态树剪切,I范围,gtools(工具),博科生物,实验中心,批注中心,基因过滤器,gplots(gplots),二次规划优化函数,S4载体 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/Bioconductor/ENmix网站 |
错误报告 |
https://github.com/Bioconductor/ENmix/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。