ENmix公司

Illumina DNA甲基化珠芯片的质量控制和分析工具


生物导体版本:释放(3.19)

用于定量控制、分析和可视化Illumina DNA甲基化阵列数据的工具。

作者:徐宗丽[cre,aut],牛良玉[aut]和杰克·泰勒[ctb]

维护人员:徐宗立<xuz at niehs.nih.gov>

引文(从R中输入引文(“ENmix”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“ENmix”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“ENmix”)
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细节

生物视图 BatchEffect(批次效果),脱氧核糖核酸甲基化,数据导入,差异甲基化,表观遗传学,免疫肿瘤学,甲基化阵列,微阵列,多通道,规范化,一个频道,预处理,主要组件,质量控制,回归,软件,双通道
版本 1.40.2
在生物导体中 生物C 3.1(R-3.2)(9.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 平行,do并行,foreach公司,总结性实验,统计,R(>=3.5.0)
进口 gr设备、图形、,矩阵统计、方法、实用程序,厄尔巴,基因绘图仪,插补,米菲,RPMM公司,照明,动态树剪切,I范围,gtools(工具),博科生物,实验中心,批注中心,基因过滤器,gplots(gplots),二次规划优化函数,S4载体
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/Bioconductor/ENmix网站
错误报告 https://github.com/Bioconductor/ENmix/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 ENmix_1.40.2.tar.gz(英文)
Windows二进制 ENmix_1.40.2.zip
macOS二进制(x86_64) ENmix_1.40.2.tgz
macOS二进制(arm64) ENmix_1.40.2.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ENmix网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/ENmix
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ENmix网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/ENmix网站/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源代码包 源存档