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EB图像

R的图像处理和分析工具箱


生物导体版本:释放(3.19)

EBImage为图像处理和分析提供通用功能。在基于(高通量)显微镜的细胞分析的背景下,EBImage提供了分割细胞和提取定量细胞描述符的工具。这允许使用R编程语言自动化此类任务,并有助于在R环境中使用其他工具进行信号处理、统计建模、机器学习和图像数据可视化。

作者:Andrzej Ole sh、Gregoire Pau、Mike Smith、Oleg Sklyar、Wolfgang Huber,以及Joseph Barry和Philip A.Marais的贡献

维护人员:安德烈·奥列·希<Andrzej.oles at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“EBImage”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“EBImage”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“EBImage”)
EBImage简介 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 软件,可视化
版本 4.46.0
在生物导体中 生物活性炭1.8(R-2.3)(18年)
许可证 LGPL公司
取决于 方法
进口 生物遗传学(>=0.7.1),图形,grDevices,统计,阿宾德,蒂夫,jpeg格式,png公司,位置匹配,fftw工具(>=0.9-7),单位:,html工具,html小部件,RCurl(RCurl)
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/aoles/EB图片
错误报告 https://github.com/aoles/EBImage/issues
查看更多
建议 生物风格,消化,针织物,rmarkdown公司,闪亮的
链接到
增强功能
取决于我 CRI图像,细胞描记器,流动捕集器,多纳PLLP2013,犁沟分段,MerfishData公司,吉纳,核素
导入我 红衣主教,分子实验,RBio格式,空间特征实验,空间Omics叠加,英国广播公司,细胞查看器,流CHIC,热图,imcR工具,simpleSeg(简单示例),突触,山药,生物图像数据库,生物图像工具,谷歌图像2Array,LFApp公司,洛马,RockFab公司,游猎
建议我 HilbertVis公司,旅行者号,德梅尔SGI,spicyWorkflow(spicy工作流),aroma.core公司,ExpImage(ExpImage),发光,伊杰蒂夫,果汁,激光雷达,超齿轮,普里曼,rcaiman公司,SIP毫克
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 EB图像_4.46.0.tar.gz
Windows二进制 EBImage_4.46.0.zip
macOS二进制(x86_64) EB图像_4.46.0.tgz
macOS二进制(arm64) EB图像_4.46.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EBImage网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/EBImage
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/EB图片/
包短Url https://bioconductor.org/packages/EBImage/
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