恐龙
单细胞mRNA序列数据的规范化
生物导体版本：释放（3.19）
恐龙在下游分析之前，对单细胞、mRNA测序数据进行标准化，以纠正技术差异，特别是测序深度。该方法生成了一个校正表达式矩阵，该矩阵的排序深度与归一化表达式的完全分布之间存在依赖关系；现有的许多方法都是为了消除序列深度和归一化表达式平均值之间的依赖性。这对于高度稀疏的数据集尤其有用，例如由10X基因组学和其他基于未知分子标识符（UMI）的微流体协议生成的数据集，否则原始表达数据中依赖深度的零比例可能会带来挑战。
作者：杰瑞德·布朗
，克里斯蒂娜·肯德佐尔斯基
维护人员：杰瑞德·布朗（Jared Brown）<brownj在ds.dfci.harvard.edu>
安装
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如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“恐龙”）
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文档
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细节
| 生物视图 |
基于细胞的分析,基因表达式,规范化,RNA序列,回归,排序,单个单元格,软件,转录组学 |
| 版本 |
1.10.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.14（R-4.1）（2.5年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=4.0.0） |
| 进口 |
生物并行,BiocSingular公司,总结性实验,单细胞实验,S4载体,矩阵,修拉,矩阵统计，平行，尖叫声，grDevices，统计数据，方法 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/JBrownBiostat/Dino网站 |
| 错误报告 |
https://github.com/JBrownBiostat/恐龙/问题 |
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