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细胞GLMM

流式细胞术和质量细胞术实验的条件差分分析


生物导体版本:释放(3.19)

CytolGLMM R包实现了两种多元回归策略:引导广义线性模型(GLM)和广义线性混合模型(GLMM)。大多数当前的数据分析工具都会跨许多计算发现的单元格类型比较表达式。CytolGLMM只关注一种细胞类型。我们的应用领域更窄,可以定义更具体的统计模型,更容易控制统计保证。因此,CytoGLMM在流式细胞术和大规模细胞术数据中发现差异蛋白,同时减少标记相关性引起的偏差,并防止患者异质性导致的错误发现。

作者:克里斯托夫·塞勒

维护人员:克里斯托夫·塞勒(Christof Seiler)在马斯特里赫特大学

引文(从R中输入引文(“CytolGLMM”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“CytolGLMM”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“细胞GLMM”)
CytolGLMM工作流 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基于细胞的分析,细胞生物学,流式细胞术,免疫肿瘤学,蛋白质组学,回归,单个单元格,软件,统计方法
版本 1.12.0
在生物导体中 生物化学3.13(R-4.1)(3年)
许可证 LGPL-3型
取决于
进口 统计、方法、,生物并行,R彩色啤酒,奶牛场,do并行,数字播放器,事实附加,柔性混音,ggplot2,马格里特,姆贝斯特,情势图,字符串,结构改变,易怒的,gg排斥,MASS(质量),登录中,矩阵,第三年,插入符号,爱尔兰航空公司,gr设备
系统要求
统一资源定位地址 https://christofseiler.github.io/CytolGLMM网址 https://github.com/ChristofSeiler/CytoGLMM(克里斯托弗·塞勒)
错误报告 https://github.com/ChristofSeiler/CytoGLMM/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 细胞GLMM_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 细胞GLMM_1.12.0.zip
macOS二进制(x86_64) 细胞GLMM_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64) 细胞GLMM_1.12.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CytolLMM(细胞GLMM)
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/CytoGLMM
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/CytolGLMM网站/
包短Url https://bioductor.org/packages/CytoGLMM/
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