CoSIA公司
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对不同物种和组织的调查
生物导体版本：释放（3.19）
跨物种调查与分析（CoSIA）是一个软件包，为研究人员提供了一种替代方法，使用来自Bgee的正常野生型RNA-Seq基因表达数据进行跨物种和组织的比较。CoSIA利用RNA-Seq基因表达数据提供了多种可视化工具，以探索基因、组织和物种间转录组的多样性和变异。CoSIA使用变异系数和Shannon熵和特异性计算转录组多样性和变异。CoSIA还提供了额外的转换工具和实用程序，为跨物种比较提供了简化的方法。
作者：阿尼莎·哈尔达尔
，维沙尔·奥扎[aut]，阿曼达·D·克拉克[cre，aut]，Nathaniel S.DeVoss[aut]，布列塔尼·拉塞涅[aut]
维护人员：阿曼达·D·克拉克<Amanda at freshairfamily.org>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“CoSIA”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
细节
| 生物视图 |
生物学问题,数据导入,图形用户界面,基因表达式,多重比较,软件,第三方客户 |
| 版本 |
1.4.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.17（R-4.3）（1.5年） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.3.0），方法（>=4.3），实验中心(>= 2.7.0) |
| 进口 |
数字播放器(>= 1.0.7),马格里特(>= 2.0.1),R彩色啤酒(>= 1.1-2),第三年(>= 1.2.0),巧妙地(>= 4.10.0),字符串(>= 1.4.0),ggplot2(>= 3.3.5),易怒的(>= 3.1.7),组织Hs.eg.db(>= 3.12.0),组织管理例会.db(>= 3.12.0),组织博士eg.db(>= 3.12.0),组织机构代码.db(>= 3.12.0),组织Dm.eg.db(>= 3.12.0),组织注册号(>= 3.12.0),注释Dbi(>= 1.52.0),生物反应器(>= 2.46.3),同源基因(>= 1.4.68.19),注释工具(>= 1.64.0),阅读器(>= 2.1.1),潮汐选择（>=1.1.2），统计（>=4.1.2） |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://www.lasseigne.org/ |
| 错误报告 |
https://github.com/lasseignelab/CoSIA/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
