圆形序列对齐Tk
圆形基因组RNA-seq数据端到端分析工具包
生物导体版本：释放（3.19）
CircSeqAlignTk旨在对环形基因组序列进行端到端RNA-Seq数据分析，从比对到可视化。它主要针对由246-401 nt环状RNA组成的类病毒。此外，CircSeqAlignTk实现了一个整洁的界面，以生成模拟真实RNA-Seq数据的合成测序数据，允许开发人员评估校准工具和工作流的性能。
作者：孙建强[cre，aut]
、习福[ctb]、魏曹[ctb]
维护人员：孙建强<Sun at biunit.dev>
引文（从R中输入引文（“CircSeqAlignTk”）)以下为：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“CircSeqAlignTk”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“CircSeqAlignTk”）
细节
| 生物视图 |
对齐,排序,小RNA,软件 |
| 版本 |
1.6.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.16（R-4.2）（1.5年） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.2） |
| 进口 |
统计、工具、实用程序，R.utils公司，方法，S4载体,爱尔兰航空公司,马格里特,数字播放器,第三年,ggplot2,生物遗传学,生物串,I范围,ShortRead（短阅读）,Rsamtools软件,鲁博蒂2,Rhisat2号机组,闪亮的,shiny文件,闪耀（shinyjs）,巧妙地，平行，html工具 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/jsun/CircSeqAlignTk |
| 错误报告 |
https://github.com/jsun/CircSeqAlignTk/问题 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
