ChIPsim公司

ChIP-seq实验模拟


生物导体版本:释放(3.19)

ChIP-seq数据模拟的一般框架。尽管目前主要关注核小体定位,但该软件包的设计目的是支持不同类型的实验。

作者:彼得·亨伯格

维护人员:彼得·亨伯格(Peter Humburg)。Humburg在gmail.com上>

引文(从R中输入引文(“ChIPsim”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“ChIPsim”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“ChIPsim”)
模拟ChIP-seq实验 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 ChIPSeq公司,基础设施,软件
版本 1.58.0
在生物导体中 生物碳2.5(R-2.10)(15年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 生物串(>= 2.29.2)
进口 I范围,十六矢量,生物串,ShortRead(短阅读),图形,方法,统计,实用程序
系统要求
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 ChIPsim_1.58.0.tar.gz公司
Windows二进制 ChIPsim_1.58.0.zip码
macOS二进制(x86_64) ChIPsim_1.58.0.tgz码
macOS二进制(arm64) ChIPsim_1.58.0.tgz码
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIPsim
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ChIPsim
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ChIPsim/
包短Url https://bioconductor.org/packages/ChIPsim/
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