癌症InSilico

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肿瘤进展计算模型的R接口


生物导体版本:释放(3.19)

CancerInSilico软件包提供了一个R接口,用于运行肿瘤进展的数学模型,并从结果中生成基因表达数据。这个包包含用C++实现的底层模型,以及用R实现的输出和分析特性。

作者:Thomas D.Sherman、Raymond Cheng、Elana J.Fertig

维护人员:托马斯·谢尔曼(Thomas D.Sherman)<tomsherman159 at gmail.com>,埃兰娜·费蒂格(Elana J.Fertig)<ejertig at jhmi.edu>

引文(从R中输入引文(“CancerInSilico”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“CancerInSilico”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

参考手册 PDF格式

细节

生物视图 生物医学信息学,细胞生物学,基因表达式,免疫肿瘤学,数学生物学,RNA序列,单个单元格,软件,系统生物学
版本 2.24.0
在生物导体中 生物化学3.4(R-3.3)(8年)
许可证 GPL-2型
取决于 R(>=3.4),卢比
进口 方法,实用程序,图形,统计
系统要求
统一资源定位地址
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包
Windows二进制 癌症InSilico_2.24.0.zip
macOS二进制(x86_64) 癌症InSilico_2.24.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CancerInSilico网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/CancerInSilico
包短Url https://bioconductor.org/packages/CancerInSilico网站/
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