CCPlotR公司

细胞-细胞相互作用可视化图


生物导体版本:释放(3.19)

CCPlotR是一个R包,用于从单细胞RNA-seq数据预测细胞间相互作用的工具中可视化结果。这些绘图是通用的,可以用于可视化来自多种工具(如Liana、CellPhoneDB、NATMI等)的结果。

作者:莎拉·埃尼斯、皮利布·布罗因[aut]、伊娃·塞格兹迪[aut]

维护人员:莎拉·恩尼斯(Sarah Ennis)<ennissarah94 at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“CCPlotR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)生物管理器::安装(“CCPlotR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“CCPlotR”)
用户指南 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 细胞生物学,网络,单个单元格,软件,系统生物学,可视化
版本 1.2.0
在生物导体中 生物柴油3.18(R-4.3)(1年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于
进口 普利尔,第三年,数字播放器,ggplot2,对于猫,gggraph图,记录仪,散乱的,绕圈子,复杂热图,易怒的,网格,ggbump(ggbump),字符串,ggtext(ggtext),ggh4倍,拼凑,R彩色啤酒,规模,病毒属,gr设备,图形,统计,方法
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/Sarah145/CCPlotR网站
错误报告 https://github.com/Sarah145/CCPlotR/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 CCPlotR_1.2.0.tar.gz公司
Windows二进制 CCPlotR_1.2.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) CCPlotR_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64) CCP标段R_1.2.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CCPlotR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/CPlotR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/CCPlotR/
包短Url https://bioconductor.org/packages/CCPlotR/
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