CBN图

基于富集分析结果从基因表达数据推断的plot贝叶斯网络


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包提供了从基因表达数据推断出的贝叶斯网络的可视化。这些网络基于从clusterProfiler和ReactomePA包推断的富集分析结果。可以推断和可视化路径和路径内基因之间的网络。

作者:佐藤北宫[cre,aut]

维护人员:佐藤诺丽(Noriaki Sato)<hgc.jp>

引文(从R中输入引文(“CBN图”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)生物管理器::安装(“CBNplot”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“CBNplot”)
CBN图 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 贝叶斯主义者,基因表达式,GeneSet扩展,网络,网络丰富,网络推理,路径,反应途径,软件,可视化
版本 1.4.0
在生物导体中 生物柴油3.17(R-4.3)(1.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.3.0)
进口 ggplot2,马格里特,石墨,gggraph图,记录仪,bn学习(>= 4.7),拼凑,组织Hs.eg.db,clusterProfiler(群集探查器),实用程序,浓缩图,重塑2,gg力,数字播放器,第三年,字符串,depmap(深度映射),实验中心,人民币,图形布局,生物文件缓存,ggdist(ggdist),呜呜声,pvclust(群集),统计,爱尔兰航空公司,oaqc
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/noriakis/CBNplot
错误报告 https://github.com/noriakis/CBNplot/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 CBNplot_1.4.0.tar.gz公司
Windows二进制 CBNplot_1.4.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) CBNplot_1.4.0.tgz文件
macOS二进制(arm64) CBNplot_1.4.0.tgz文件
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CBNplot网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/CBNplot
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/CBNplot网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/CBNplot网站/
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