CBN图
基于富集分析结果从基因表达数据推断的plot贝叶斯网络
生物导体版本:释放(3.19)
该软件包提供了从基因表达数据推断出的贝叶斯网络的可视化。这些网络基于从clusterProfiler和ReactomePA包推断的富集分析结果。可以推断和可视化路径和路径内基因之间的网络。
作者:佐藤北宫[cre,aut]
维护人员:佐藤诺丽(Noriaki Sato)<hgc.jp>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)生物管理器::安装(“CBNplot”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“CBNplot”)
细节
生物视图 |
贝叶斯主义者,基因表达式,GeneSet扩展,网络,网络丰富,网络推理,路径,反应途径,软件,可视化 |
版本 |
1.4.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.17(R-4.3)(1.5年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=4.3.0) |
进口 |
ggplot2,马格里特,石墨,gggraph图,记录仪,bn学习(>= 4.7),拼凑,组织Hs.eg.db,clusterProfiler(群集探查器),实用程序,浓缩图,重塑2,gg力,数字播放器,第三年,字符串,depmap(深度映射),实验中心,人民币,图形布局,生物文件缓存,ggdist(ggdist),呜呜声,pvclust(群集),统计,爱尔兰航空公司,oaqc |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
https://github.com/noriakis/CBNplot |
错误报告 |
https://github.com/noriakis/CBNplot/issues |
查看更多
建议 |
针织物,阿勒斯,凹地人,反应omePA,bn查看器,设计2,地理查询,市场营销,用r,仿生风格,测试那个(>= 3.0.0) |
链接到 |
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程序包档案
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