CBEA公司
R中分类富集分析的竞争平衡
生物导体版本：释放（3.19）
该软件包实现了CBEA，这是一种对微生物相对丰度数据进行基于集合的分析的方法。这种方法在集合内的分类群和每个样本的剩余分类群之间建立了竞争平衡。更多细节见Nguyen等人2021+手稿。此外，该软件包还添加了支持功能，以帮助用户使用现有的基因集分析方法执行分类集富集分析。未来，我们还希望提供精心策划的知识驱动分类群。
作者：广元[aut，cre]
维护人员：Quang Nguyen<gmail.com上的quangpmnguyen>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“CBEA”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“CBEA”）
细节
| 生物视图 |
数据导入,GeneSet扩展,基因组,微生物组,软件 |
| 版本 |
1.4.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.15（R-4.2）（2年） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.2.0） |
| 进口 |
生物并行,生物集,数字播放器,lmom公司,菲迪斯特普卢斯,马格里特、方法、，混合工具,卢比（>=1.0.7），统计，总结性实验,易怒的,树总结实验,第三年,胶,泛型,爱尔兰航空公司,戈夫特 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/qpmnguyen/CBEA网站 https://qpmnguyen.github.io/CBEA/ |
| 错误报告 |
https://github.com/qpmnguyen/CBEA//问题 |
查看更多
| 建议 |
品学兼优,仿生风格,冠状病毒,针织物,参考管理器,rmarkdown公司,sessioninfo（会话信息）,测试那个(>= 3.0.0),潮汐,氧气2,米娅,呜呜声 |
| 链接到 |
卢比 |
| 增强功能 |
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| 取决于我 |
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| 导入我 |
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| 建议我 |
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| 指向我的链接 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
