生物NAR

R中的生物网络分析


生物导体版本:释放(3.19)

R包BioNAR,用于PPI网络的逐步分析。其目的是基于网络拓扑和聚类将每个蛋白质的同时影响量化并排序为多个复合物。该软件包还可以估计整个网络和指向共享/通用机制的特定集群中的疾病共存情况。

作者:科林·麦克林[aut]、安纳托利·索罗金[aut,cre]、奥克萨娜·索罗基纳[aut]J·道格拉斯·阿姆斯特朗[aut、fnd]、T·伊恩·辛普森[ctb、fnd]

维护人员:安纳托利·索罗金(Anatoly Sorokin)<lptolik at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“BioNAR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“BioNAR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“BioNAR”)
BioNAR:R中的生物网络分析 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 图形和网络,网络,软件
版本 1.6.3
在生物导体中 生物柴油3.16(R-4.2)(2年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.5.0),记录仪(>= 2.0.1.1),权力法律,最晚2个月,R光谱,Rdpack公司
进口 字符串,病毒属,集群Cons,fgsea公司,网格,方法,注释Dbi,数字播放器,政府.db,组织Hs.eg.db(>= 3.19.1),r光谱,WGCNA公司,ggplot2,gg排斥,最小包装.lm,奶牛场,数据表,规模,统计,矩阵
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/lptolik/BioNAR/issues(https://github.com/lptolik/BioNAR/issues)/
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 生物NAR_1.6.3.tar.gz
Windows二进制 生物NAR_1.6.3.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 生物NAR_1.6.3.tgz
macOS二进制(arm64) 生物NAR_1.6.3.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioNAR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/BioNAR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/BioNAR/
包短Url https://bioconductor.org/packages/BioNAR/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包 源存档