生物NAR
R中的生物网络分析
生物导体版本:释放(3.19)
R包BioNAR,用于PPI网络的逐步分析。其目的是基于网络拓扑和聚类将每个蛋白质的同时影响量化并排序为多个复合物。该软件包还可以估计整个网络和指向共享/通用机制的特定集群中的疾病共存情况。
作者:科林·麦克林[aut]、安纳托利·索罗金[aut,cre]、奥克萨娜·索罗基纳[aut]J·道格拉斯·阿姆斯特朗[aut、fnd]、T·伊恩·辛普森[ctb、fnd]
维护人员:安纳托利·索罗金(Anatoly Sorokin)<lptolik at gmail.com>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“BioNAR”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“BioNAR”)
细节
生物视图 |
图形和网络,网络,软件 |
版本 |
1.6.3 |
在生物导体中 |
生物柴油3.16(R-4.2)(2年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=3.5.0),记录仪(>= 2.0.1.1),权力法律,最晚2个月,R光谱,Rdpack公司 |
进口 |
字符串,病毒属,集群Cons,fgsea公司,网格,方法,注释Dbi,数字播放器,政府.db,组织Hs.eg.db(>= 3.19.1),r光谱,WGCNA公司,ggplot2,gg排斥,最小包装.lm,奶牛场,数据表,规模,统计,矩阵 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
|
错误报告 |
https://github.com/lptolik/BioNAR/issues(https://github.com/lptolik/BioNAR/issues)/ |
查看更多
建议 |
针织物,仿生风格,魔法,rmarkdown公司,图表数据,测试那个(>= 3.0.0),vdiffr公司,开发工具,迎合,巧妙地,随机coloR |
链接到 |
|
增强功能 |
|
取决于我 |
|
导入我 |
|
建议我 |
|
指向我的链接 |
|
生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。