BUScorrect（总线校正）

使用未知子类型的批处理效果更正

生物导体版本：释放（3.19）

高吞吐量的实验数据在公共数据库中呈指数级累积。然而，从这些丰富的资源中挖掘有效的科学发现受到技术人工制品和固有生物异质性的阻碍。前者通常被称为“批量效应”，后者通常由“子类型”建模。R包BUScorrect适合贝叶斯层次模型，即批量效应-校正-带未知子类型模型（BUS），用于在存在未知子类型的情况下纠正批量效应。BUS能够（a）明确纠正批量效应，（b）将具有相似特征的样本分组为子类型，（c）识别区分子类型的特征，以及（d）具有线性顺序计算复杂性。

作者：罗香玉（Xiangyu Luo）<xyluo1991（gmail.com>），魏英英（Yingying Wei）<yweicuhk（gmail.com）

维护人员：罗翔宇<xyllo1991在gmail.com>

引文（从R中输入引文（“BUScorrect”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）生物管理器：：安装（“BUScorrect”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“BUScorrect”）

BUScorrect_用户指南	PDF格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	BatchEffect（批次效果）,贝叶斯主义者,群集,特征提取,基因表达式,软件,统计方法
版本	1.22.0
在生物导体中	生物技术3.8（R-3.5）（6年）
许可证	GPL（>=2）
取决于	R（>=3.5.0）
进口	gplots（gplots），方法，grDevices，统计，总结性实验
系统要求
统一资源定位地址

建议	仿生风格,针织物,RUnit（运行单位）,生物遗传学
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	总线修正_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	BUScorrect_1.22.0.zip总线
macOS二进制（x86_64）	总线修正_1.22.0.tgz
macOS二进制（arm64）	总线修正_1.22.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BUS更正
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/BUScorrect
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/BUScorrect网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/BUS更正/
软件包下载报告	下载统计信息