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BREW3R公司。第页

与BREW3R关联的R包


生物导体版本:释放(3.19)

此R包提供BREW3R工作流中使用的功能。这主要包含一个函数,该函数使用另一个gtf(也作为GRanges)中的信息将gtf扩展为GRanges。该过程允许在不增加基因id之间重叠的情况下扩展基因注释。

作者:露西尔·洛佩兹·德利斯勒[aut,cre]

维护人员:露西尔·洛佩兹·德利斯勒(Lucille Lopez-Delisle)

引文(从R中输入引文(“BREW3R.r”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“BREW3R.r”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“BREW3R.r”)
BREW3R公司。第页 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基因组注释,软件
版本 1.0.1
在生物导体中 生物活性碳3.19(R-4.4)(<6个月)
许可证 GPL-3公司
取决于
进口 基因组范围、方法、,爱尔兰航空公司,S4载体,实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/lldelisle/BREW3R.r
错误报告 https://github.com/lldelisle/BREW3R.r/issues网站/
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建议 测试(>= 3.0.0),I范围,针织物,rmarkdown公司,仿生风格,rtracklayer公司
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 BREW3R.r_1.0.1.tar.gz公司
Windows二进制 BREW3R.r_1.0.1.zip系列
macOS二进制(x86_64) BREW3R.r_1.0.1.tgz公司
macOS二进制(arm64) BREW3R.r_1.0.1.tgz公司
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BREW3R.r
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/BREW3R。第页
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/BREW3R.r/
包短Url https://bioconductor.org/packages/BREW3R.r/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包 源存档