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BG2公司

使用BG2对非高斯数据执行贝叶斯GWAS分析


生物导体版本:释放(3.19)

此软件包用于使用BG2对非高斯数据执行GWAS分析。BG2方法使用惩罚准似然和非局部先验,分两步识别GWAS分析中的SNP。与该包相关的研究部分得到了国家科学基金会DMS 1853549和DMS 2054173奖的支持。

作者:雅各布·威廉姆斯,许双双[aut],马可·费雷拉[aut]

维护人员:雅各布·威廉姆斯(Jacob Williams)

引文(从R中输入引文(“BG2”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“BG2”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“BG2”)
BG2公司 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
许可证 文本

细节

生物视图 AssayDomain(分析域),贝叶斯主义者,基因组广泛关联,SNP公司,软件
版本 1.4.0
在生物导体中 生物C 3.17(R-4.3)(1年)
许可证 GPL-3+文件许可证
取决于 R(>=4.2.0)
进口 (>= 3.2),插入符号(>= 6.0-86),备忘录(>= 1.1.0),矩阵(>= 1.2-18),MASS(质量)(>=7.3-58.1),统计(>=4.2.2)
系统要求
统一资源定位地址
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建议 生物风格,针织物,rmarkdown公司,格式R,rrBLUP公司,测试那个(>= 3.0.0)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 BG2_1.4.0.tar.gz公司
Windows二进制 BG2_1.4.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) BG2_1.4.0.tgz
macOS二进制(arm64) BG2_1.4.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BG2
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/BG2
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/BG2网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/BG2/
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