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BE清除

DNA甲基化数据中批效应的校正


生物导体版本:释放(3.19)

提供检测和纠正DNA甲基化数据中批次效应的功能。核心函数基于潜在因子模型,也可用于预测任何其他包含实数的矩阵中的缺失值。

作者:利维亚·拉斯普[aut,cre]、马库斯·梅尔[aut]、鲁斯兰·阿库连科[aut]

维护人员:Livia Rasp<Livia.Rasp at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“BEclear”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“BEclear”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“BEclear”)
BEclear教程 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 BatchEffect(批次效果),脱氧核糖核酸甲基化,预处理,软件,统计方法
版本 2.20.0
在生物导体中 生物技术3.1(R-3.2)(9年)
许可证 GPL-3型
取决于 生物并行(>= 1.14.2)
进口 无用的日志,Rdpack公司,矩阵,数据表(>= 1.11.8),卢比,阿宾德、stats、graphics、utils、methods、,迪克森试验,身份证
系统要求 C++11语言
统一资源定位地址 https://github.com/uds-helms/BEclear网址
错误报告 https://github.com/uds-helms/BEclear/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 BEclear_2.20.0.tar.gz
Windows二进制 BEclear_2.20.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) BEclear_2.20.0.tgz清洁剂
macOS二进制(arm64) BEclear_2.20.0.tgz清洁剂
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BEclear网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:程序包/BE清除
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/BE清除/
包短Url https://bioconductor.org/packages/BEclear网站/
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